Esta pregunta es muy curiosa.  A veces no conocemos en profundidad el comportamiento de las tortugas, pero lo cierto es que en sus actividades diarias pueden hacer cosas increíbles, aunque no parezca.  La mayoría de las especies tienen diferentes rituales cuando se aparean y llaman mucho la atención, porque a pesar de que normalmente no emiten ningún sonido, en el apareamiento se puede escuchar algún gemido.

Y esto precisamente se debe a lo que estás preguntando, porque en muchos casos los machos se montan encima de la hembra y la muerden para asegurar la cópula. El macho sostiene a la hembra con sus patas y uñas, pero también la muerde para demostrar autoridad y así obligarla a permanecer quieta.  Es un comportamiento natural a la hora de aparearse, así que no debes preocuparte.

No es tan grave para la tortuga hembra aunque pareciera estar sufriendo.  También puede suceder que antes de aparearse, el macho quiera demostrar ante otros su superioridad mordiendo a la hembra, incluso puede darle toques en la cabeza para pedir aprobación.